郑州大学神经科学研究院是2018年5月经学校批准成立，依托第三附属医院建设的学术机构,聘任复旦大学杨雄里院士担任研究院名誉院长。2018-2021年四年建设期间，郑州大学以及第三附属医院对等投入共8000万元，用于神经科学研究院各平台的建设。
    2019年9月，研究院成立了由国内13所高校或研究院17位神经领域资深专家组成的第一届学术委员会，主任委员为首都医科大学原副校长王晓民教授，副主任委员为军事医学科学院王以政院士、海军军医大学何成教授。2020年3月，研究院提前完成初期目标任务，郑州大学神经科学与行为学学科成为我校第8个进入ESI排名前1%学科。2023年3月，学科ESI排名为4.92‰，成功进入前千分之五，提前完成中期目标任务。
    研究院占地5000平米，设立有分子实验室、蛋白实验室、组织实验室、显微成像实验室、免疫实验室。配置了MR solution 4.7T小动物核磁成像系统以及10x的全自动单细胞建库平台，蔡司LSM9系列共聚焦显微镜和活细胞工作站用于显微研究，开放共享设备共24台，2022年开放机时4万多小时。5楼整层为郑州大学附属医院中唯一的通过审批的标准SPF动物房，重点进行转基因鼠的繁育以及各种神经行为功能的测定，可满足神经行为学动物研究需求。
    研究院与瑞典哥德堡大学、卡罗林斯卡医学院、德国马堡大学、澳大利亚阿德莱德大学、美国哈佛大学、哥伦毕业大学等世界知名高校开展了合作研究。在学校的大力支持下，经过近五年的建设，研究院目前已经建成了比较完善的神经科学领域研究平台。
    在郑州大学的大力支持下，神经科学研究院将以四个面向为纲，坚持多学科交叉融合，梳理三附院和学校各学院、各附属医院神经科学领域的优势资源，探索神经科学研究院与三附院专科深度融合新途径，推动神经科学学科发展及脑重大疾病防治的突破，努力将研究院打造成成为中原脑科学研究高地，为健康中国、健康中原及郑州大学双一流建设贡献力量。